Thomas Francis và vợ là Marie không sống và phát triển sự nghiệp tại Turin, thủ đô của Công quốc Savoia, họ đã đến Paris, nơi mà vợ ông hưởng được địa vị quý tộc princesse du sang, vì bà là em họ đời thứ 2 của Vua Louis XIII của Pháp. Bản thân Thomas đã được xếp vào địa vị là một hoàng tử, con trai của một vị quân chủ đang trị vì một lãnh thổ độc lập, vì thế ông giữ địa vị hàng đầu trong các Thân vương ngoại quốc (Prince étranger) ở triều đình Pháp - xếp trên cả Nhà Guise, người có quan hệ họ hàng với Công tước xứ Lorraine.[1] Ông được bổ nhiệm làm Grand Maître của gia đình nhà vua, thay thế cho Louis II de Bourbon. Ông đã mời Claude Favre de Vaugelas làm gia sư cho các con của mình.

Marie hy vọng sẽ được kế thừa Thân vương quốc Neuchâtel ở Thụy Sĩ, gần Savoia, nhưng vua Pháp đã chấm dức hy vọng này vào năm 1643, khi ông quyết định hợp pháp cho Louis Henri de Bourbon, Hiệp sĩ de Soissons (1640–1703), con trai của người anh trai quá cố của Marie. Điều này đã ngăn cản Nhà Savoia ảnh hưởng lên khu vực đó, vì thế Thomas chỉ sở hữu tước hiệu "Thân vương xứ Carignan". Marie cuối cùng đã thừa kế quyền sở hữu tài sản của anh trai mình ở Pháp, Bá quốc Soissons, nhưng tài sản này được xem như một cơ sở hạ tầng cho chi nhánh Pháp của gia tộc. Sau Thomas Francis, dòng dõi cao cấp của ông trở về Savoia, lần lượt kết hôn với các vương nữ Pháp, Ý và Đức.[2]